DNA的基本元素包括腺嘌呤（A）、胸腺嘧啶（T）、鳥嘌呤（G）、胞嘧啶（C）和脫氧尿嘧啶（dU），然而目前還無法從單堿基分辨率水平上檢測dU，嚴重影響了對dU功能的理解。近期，我國科學家研發出在單堿基分辨率水平上精準檢測dU的新技術，研究成果發表在《Journal of the American Chemical Society》期刊，標題為“UdgX-Mediated Uracil Sequencing at Single-Nucleotide Resolution”。

該方法被命名為Ucaps-seq法（UdgX cross-linking and polymerase stalling sequencing）。研究人員利用從恥垢分枝桿菌中發現的新型糖苷酶UdgX，特異性地識別和切除DNA中的dU，形成的缺口與對應的核糖形成共價鍵，從而將其捕獲。由于DNA高保真聚合酶碰到UdgX標記的dU缺口能原地“停車”，研究人員利用的DNA高保真聚合酶這一特性進一步確認了dU的位置。最后，結合高通量測序技術將“停車”信號放大，從而在單堿基水平上精準定位dU在DNA乃至基因組上的位置。

Ucaps-seq法是國際上第一個酶法檢測DNA中的dU堿基的技術，靈敏性好、特異性強、分辨率高，將大大推進核酸序列檢測、遺傳密碼破譯和人類對核酸的認知。

注：此研究成果摘自《Journal of the American Chemical Society》期刊原文章，文章內容不代表本網站觀點和立場，僅供參考。

論文鏈接：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jacs.1c11269

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