胚胎正常發育需要基因表達的時空調控。單細胞技術的發展使研究早期胚胎調控具有更高的分辨率，如對小鼠胚胎發育過程中多數細胞狀態的詳細分子定義。德國馬克斯·普朗克分子遺傳學研究所等機構揭示小鼠胚胎器官形成初期的時空轉錄圖譜。該研究成果于近日發表在《Nature Genetics》雜志上，題為：Spatiotemporal transcriptomic maps of whole mouse embryos at the onset of organogenesis。

研究人員使用Slide-seq技術建立了完整胚胎第8.5天、第9.0天以及部分胚胎第9.5天的空間轉錄圖譜。為了支持其實用性，他們開發了一種工具sc3D，重建和探索三維“虛擬胚胎”以定量研究區域化基因表達模式。研究人員進一步對神經管發育進行了研究，揭示了神經管發育中背腹軸和頭尾軸上新的差異基因分布具有獨特的空間模式。此外，通過建立Tbx6突變體胚胎，他們利用空間組學驗證了敲除表型的缺失并且被神經管替代，并發現異位神經管的分子特征與過去研究有所不同。

綜上，該研究為整個胚胎結構和突變體表型的時空研究提出了新的實驗基礎和計算框架。

注：此研究成果摘自《Nature Genetics》雜志，文章內容不代表本網站觀點和立場，僅供參考。

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